广东海洋大学教育质量监控与评估中心、航海教育质量管理办公室于2018年12月成立，为学校行政职能部门，现有干部5名。主要负责本科专业认证、本科教学评估、本科教学督导、教学状态数据监测与采集、本科教学质量报告等的组织、编制、管理和服务工作，负责学校船员培训质量管理体系的组织、运行与改进工作。

内设教学质量监控科和教育质量评估科，航海教育质量管理办公室及本科教学督导组办公室日常工作由教学质量监控科负责。